这是一个人与英灵共存的世界，当孩子年满十岁之时，便要领取自己的初始英灵，成为英灵训练家踏上旅途。
来自真新镇的少年小智，因为迟到没能得到御三家，作为补偿他得到了一只金闪闪脾气差的双马尾英灵——吉尔。
目标是成为英灵大师，小智的旅途就此开始了，开始了他与众多英灵的邂逅。
一刻都来不及为宝可梦训练家小智的消失而悲伤，即将赶到战场的是：摄影师迦尔纳永远注视之人！最古之王金皮卡的至死不渝！游星尖兵阿蒂拉心灵寄托！反转世界女王斯卡哈的关门弟子！源赖光的心头挚爱！艾蕾什伽基尔的圈外男友……英灵魅魔人类形态——英灵大师小智！