圣杯(San-greal)是在公元33年，犹太历尼散月十四日，也就是耶稣受难前的逾越节晚餐上，耶稣遣走加略人犹大后和11个门徒所使用的一个葡萄酒杯子。耶稣曾经拿起这个杯子吩咐门徒喝下里面象征他的血的红葡萄酒，借此创立了受难纪念仪式。后来有些人认为这个杯子因为这个特殊的场合而具有某种神奇的能力。42NeR12
这个源自于基督的传说的奇迹之遗物，在很多传说中，如果能找到这个圣杯而喝下其盛过的水就将返老还童、死而复生并且获得永生。42NeR3
而对于生活在现实世界另外一面的神秘侧而言，圣杯则是通往着根源的通道。什么是根源？很多的魔术师们相信，根源即根源之涡的称呼，或是对根源之涡这种"存在状态"的称呼。应该是一切的"因"，各种现象起始之处。由于只要有"因"就能产生"果"，因此以存在来说，这即是"究极的知识"。而魔术师们的毕生最求，就是抵达顶点的存在，所以，根源是所有魔术师都梦寐以求的终极目标，也是人类一生都无法达到了梦幻之地，人类前往根源之涡会因此掌握世界万事万物的根本因果与法则，想要修改世界的格局与秩序，换言之就是创造新世界以及毁灭旧世界。42NeR9
但这其中究竟有多少是真实的，多少事臆想出来的，谁也不知道。抵得过根源的人有多少，有谁，全都不清楚。唯一知晓的是，有人能掌握从根源中流淌出的名为“法”的规则和力量。目前已知掌握了魔法的人为第二魔法使的宝石翁-魔导元帅泽尔里奇，能力体现为平行空间干涉。42NeR6
所以对于魔术师而言，无论是为了掌握力量、追求真理……都有着追求根源的目标，而在这种情况之下，和第三法有关的仪式就此展开。其本意就是借助着一个仪式，汇聚到足够的力量，然后打开前往“根源”的道路，然而在实际中发现，仅凭借在人类本身根本不可能拥有如此强大的力量，更何况作为驻守在“根源”前的两大抑制力，盖亚和阿赖耶也不会允许魔术师们去到“根源”所在……42NeR15
最后有了一个新的方法来解决这个问题，那就是通过作为第三法的‘天之杯’来实现。以第三法的精神/灵魂的物质化，来召唤已经逝去的英灵，通过献祭英灵们的灵魂，通过将死去的六名Servant的灵魂注入小圣杯，利用他们回归位于世界外侧的"英灵之座"的力量将世界穿孔，并以大圣杯中积累的庞大魔力来固定这个孔，从而制造出前往世界之外的门，也就是通往‘根源’。42NeR3
但是，第三魔法使早已消失，第三法‘天之杯’已经失落。于是，以掌握了部分第三法的人造人冬之圣女羽斯缇萨·里姿莱希·冯·爱因兹贝伦作为牺牲品，将她的魔术回路分解、魔术式置换的人体宇宙--这样的构想即是大圣杯，但是。大圣杯的制造着手时，只有羽斯缇萨是不够的这样的事情判明了。大圣杯可以建造、炉心确实可以制作、但是，发动大圣杯需要极其庞大的魔力，将其制御的小圣杯是必要的。42NeR1
最终，远坂家族、爱因兹贝伦家族、玛奇里家族(间桐家族)，被誉为御三家的三个魔术师家族联合在了一起，共同完成了名为‘圣杯战争’的仪式。42NeR1
魔术师为御主，以用圣杯来实现愿望为诱饵，提供魔力召唤出Servant，共同来进行一场战争仪式，为了打开‘根源’的道路而殊死搏杀。没有投降、没有惋惜，七对御主和Servant的组合，唯有一对为最终的胜利者。42NeR
这就是——圣杯战争。42NeR10
第一次战争，由于事先没有正式订下规则，Master作为"参加者"的意识稀薄。另一方面，由于没有后来现在那样的令咒，所以出现从者不服从命令的情况等原因，这次圣杯召唤尚未形成仪式的外形就失败了。圣杯降临地点是柳桐寺，时间为公元1800年。42NeR
第二次圣杯战争，约1860年，工业革命后的圣杯战争。鉴于第一次的失败而规划出细节规则才举行的一届。虽然"令咒系统"完成，Master能够随意使役从者，但因诸多原因仪式却以失败告终，圣杯降临地点是远坂府邸。42NeR
第三次，在第二次世界大战前夕举行的一届。但是也应为种种的原因最终犹如被诅咒一般导致了失败，大圣杯被通过小圣杯吸收安哥拉曼纽污染。因此圣杯发生了决定性、根本上的变质。虽然这次圣杯战争是"作废比赛"，但"大圣杯的污染"这一结果继续为下届以后的战争带来影响。42NeR
时间来到了1990年，实隔了数十年之后，第四次圣杯战争又一次在名为冬木市的城市中再度来临。42NeR2
和往届相比，这一次的圣杯战争因为参与者的个人原因，从而变得更加的残酷……以及黑暗。42NeR18
世界之外，是一片空无一物的地方，因为这连颜色的感念也没有以至于呈现出了一片虚无。而在这个地方，两个对坐一张桌子前的小女孩同一时间睁开了双眼。同时，两个长得一模一样，一个穿着白色衣服，一个穿着黑色衣服的小女孩同一时间将目光看向了某个未知之处。42NeR27
在她们的双眼中倒映出了一片无边无际的星空，那并非现实中的宇宙星河，而是某种概念意义上的地方，在那里，每一颗闪烁的星辰，与其说是一颗星球，更切确说是一个晶壁或者位面。42NeR
而就在这无尽的星河当中，一颗划过星河的彗星正在朝着她们所在的位置而来。42NeR
“外来者？”黑色长裙的小女孩皱了皱眉头，开口说道“晶壁之外的来客？需要派出守护者清理么？”42NeR
“恩……”白色长裙的小女孩迷糊的看着眼前，发出了一声软绵绵的声音。42NeR
“盖亚！”见状，黑色长裙的小女孩不满的大叫了起来，用力的拍着桌子啪啪啪的响“你这个笨蛋别再这种时候犯迷糊好不好，有外来者入侵了啊！”42NeR21
“恩，我才不是笨蛋，阿赖耶才是！”听到黑色长裙的小女孩的话，白色长裙的小女孩也就是盖亚顿时一抖，不满的反馈了回去。“阿赖耶才是笨蛋，盖亚不是的……”42NeR
“那你至少别给我在这种时候犯迷糊！”阿赖耶怒视着盖亚“到底要不要派出守护者去清缴。”42NeR
“恩……不行啊！”伸手揉了揉自己的脸，盖亚略微苦恼的说道“不行的，那个家伙身上带有通行证，拦不住的，根源是不会阻拦他来到这里的。何况，他的力量复制的来源，那个位面太过于危险了，把他留在这个世界一个不好可能会引起那个位面的注意，我们这里可没有可以屏蔽信息交汇的东西，一个不好我们这里就会搞出来一大堆的麻烦。”42NeR42
“那怎么办，总归不能够让那个外来者破坏我们的世界吧！”42NeR
“恩……啊啊啊啊，好烦啊，好烦啊！”盖亚搓了搓自己的头发，然后将身子趴在了桌子上。“人家不想管了啊！太麻烦了！”42NeR
“你这算什么抑制力啊，笨蛋盖亚！”阿赖耶不满的看着眼前在卖萌的盖亚，然后无奈的说道“那就这样吧！反正他来也只是为了那个见鬼的仪式，就让他和那些同样白痴的魔术师打交道好了……对了，正好趁着这个机会把那个不可燃垃圾丢出去好了。”42NeR23