故事中各项城市建设都相当前卫，富有概念性。相对作品制作时间来说是发生在未来的事。lgVlN
角色所居住的地方。急速发展，坐拥较先进的建筑物和设施，包括数年前大幅改建的见泷原中学，也就是大部分角色就读的学校。[10-11]lgVlN
宇宙中拥有古老文明的种族——孵化者（Incubator），见证了人类从原始社会发展至今的文明。除极少数个体外不存在感情，拥有能将感情转化为能量的技术。为了满足宇宙无数种族的能量消耗、避免整个宇宙陷入热寂的状态而寻找能源，后发现人类的感情转化而来的能量竟能凌驾于熵，于是决定牺牲人类个体的一小部分来为全宇宙提供能量。与拥有资质的少女签订契约，实现少女的愿望并令其成为魔法少女。lgVlN
指“成为魔法少女”的契约。丘比会实现任何愿望，但作为代价，少女们会成为魔法少女，肩负与魔女战斗并消灭魔女的使命。否则，会因为灵魂宝石的污秽积累变为魔女。lgVlN
与孵化者签订协约的少女。身体本身不具备灵魂，灵魂存放在“灵核”内。签订协约时，需要先许一个愿望。那个愿望决定该魔力初次生效的效应，以及魔法少女所拥有的初始技能。许愿衍生的技能会受到许愿者心理活动的影响（例如杏子的幻惑技能被封印）。由于魔法少女们所许的愿望各不相同，因此在能力方面大都自成一家，能力相同者至今未出现。由于灵魂被单独抽出，拥有类似僵尸的性质，身体被伤害、破坏后可以使用灵核来修复，并不会死亡。“只要灵核不被破坏就是无敌的存在”（Incubator原话如此）。旧世界中，最后大都因为陷入绝望或灵魂宝石被污染而成为魔女，新世界中最终会因为“圆环之理”凭空消失。与魔女不同的是，变身后的魔法少女仍然可以被普通人类发现，这给魔法少女的魔女退治工作造成了一定程度上的妨碍。[12]lgVlN1
魔法少女旧世界中的最终归宿。因为希望转变为绝望而堕入内心的黑暗，或者灵核没有来得及净化，都会导致魔法少女转变为魔女。魔女躲在自己的结界中，到处散播绝望。普通人类看不到魔女。lgVlN
因为每个魔法少女生前的能力和经历不同，每个魔女的形象、能力、结界内置都各成一家，并且也存在大量物象来暗示这个魔女生前的经历。例如沙耶香变成的人鱼骑士，其实人鱼骑士的形象暗示其生前的魔法少女形象和能力，人鱼象征悲恋，不断演奏的弦乐象征她未能实现的爱情，时常展示的伸臂求拥抱手势象征她生前寂寞。[13]lgVlN
魔女的分身，同样会迷惑人类，成长到一定程度会变成魔女。[14]lgVlN
被魔女控制的人身上的某种纹章。每个魔女都有属于自己的纹章，被哪个魔女迷惑，身上就会出现相应魔女的纹章。世界上很多莫名其妙的自杀事件都和魔女之吻有关。[15]lgVlN
被丘比选中的女孩由于契约产生的宝石，即灵核。是魔力之源，也是魔法少女的证明，同时也是魔法少女自身灵魂的容器。经丘比的提取，魔法少女的灵魂和肉体相剥离，魔法少女成为“僵尸”一般的人。身体由灵魂之石遥控，范围大致是半径一百米。使用魔法、战斗时消耗魔力，伤痛情绪积累或魔法少女本人陷入绝望都会使得灵核浑浊，需要定期用悲叹之种吸取污浊。当魔法少女的灵魂宝石被完全污染变为漆黑的时候便会诞生悲叹之种。灵魂宝石破碎产生悲叹之种时，会释放庞大的能量。[16]lgVlN
由魔法少女的灵魂宝石黑化后破碎产生，也可以在击败魔女后获得。它能吸收灵魂宝石的污秽，是灵魂宝石的重要净化道具。因污秽的收纳量有限而存在使用次数的限制，达到使用次数限制的种子一定时间后会引起魔女的孵化。为了避免“好不容易击倒了魔女获取了种子，却因为种子使用过多而又孵化出了新一代魔女”这类情况的出现，丘比负责将使用过多的悲叹之种吃掉。一说是悲叹之种与灵魂宝石类似，本质是被绝望侵蚀的灵魂，蕴含绝望所带来的灵魂能量，孵化者一族回收后可作提取能量之用。[17]lgVlN1
第12话出现的怪物。鹿目圆修正世界后，魔女不再存在，取而代之的是来源于人类内心黑暗的魔兽。悲叹之种亦不再存在，魔法少女的灵魂宝石由魔兽掉落的黑色方块（魔兽之卵）净化，使用后的方块仍由丘比回收。根据虚渊玄的访谈，魔兽就是原本魔女把魔法少女吃掉后（指魔法少女被绝望的诅咒吞食成为魔女）本应该四散消失的诅咒，在放射之后形成的诅咒，比魔女的密度要薄，取而代之的是诅咒的范围扩大（诅咒力量较魔女弱但影响范围比魔女要广）。lgVlN
在重组后的世界，小圆会在魔法少女们变成魔女前夕将她们接走救赎。这种魔法少女最终必定会凭空消失的法则被魔法少女们称为“圆环之理”。lgVlN
魔法少女旧世界中的最终归宿。因为希望转变为绝望而堕入内心的黑暗，或者灵魂宝石没有来得及净化，都会导致魔法少女的灵魂宝石转化为悲叹之种，转变为魔女。魔女躲在自己的结界中，到处散播绝望。普通人类看不到魔女。魔女也会使用魔女之吻控制人类。lgVlN
当魔女被魔法少女杀死后，有几率掉落悲叹之种，可以用来吸收灵魂宝石中的污秽，但到一定阶段会孵化魔女，因此用尽的悲叹之种会被丘比回收。此外，魔女的分身使魔在吃了一定数量的人类后也会成长为魔女。lgVlN
即使是同一魔法少女也可能转变为不同的魔女，拥有不同的使魔。因为每个魔法少女生前的能力和经历不同，每个魔女的形象、能力、结界内置都各成一家，并且也存在大量物象来暗示这个魔女生前的经历。魔女结界外部常受外在环境影响，随着向结界深处的探索，会越来越呈现魔女自身的风格，而极为强大的魔女如魔女之夜往往不需要结界的保护。lgVlN
圆神的粉红色头发延长至无限远，两侧的头发由一对雪白色蝴蝶结束缚着，女神化后瞳孔泛出金色的光辉。其衣饰为纯白的魔法长裙，背部及鞋后跟均有白色的天使羽翼[4]。她的衣领处有一道波浪状的切口，胸口处有一钻石状镂空，顶端镶着红色宝石。袖子短而宽畅，顶部为白色，底部为粉色。与魔法少女时期相同的是，她仍然戴着白色手套，但腿上改穿粉红色长筒过膝袜。裙子内有三层，底层是粉红色，每层下均包罗万象，蕴藏着无限宇宙。同时这个状态也是「无限时空战斗之超进化所产生的究极型态」，在原本剧本之中将此时的圆称为「超级最终型态鹿目圆」lgVlN1
在其他时间轴中许下了许多不同的愿望，但是这些愿望的内容皆是为了别人的幸福所许下的，从来没有将自己的利益作为第一位考虑过。根据广播剧《Memories of You》的演出内容，在第一个时间轴中之所以选择成为魔法少女是因为要让被车撞死的黑猫艾米复活才订下契约。lgVlN
其他时间轴中所许下的愿望，还包括希望家里所有人感到幸福、帮助苦战中的焰击败魔女之夜、让沙耶香变回普通人等要求。受到愿望影响，鹿目圆在各个时间轴中拥有不同的魔法能力，除了弓箭魔法，还包括身体魔力上升、治疗伤势、甚至是消除部分灵魂宝石污染等魔法[7]。lgVlN
鹿目圆的灵魂宝石破裂后变身而成。魔法质量超过物质界，因此是魔女中最强大的一位[8]。虽然为救济魔女，但破坏力十分强大，可轻易毁灭地球。想要打败她的话，需要消除这个世界上的一切绝望，这样会让她误以为身在天堂。lgVlN