第二次世界大战的太平洋海战是从一次反潜作战开始的。大约在南云中将的飞机出现在瓦胡岛上空1小时之前， 美国驱逐舰”伍得”号就在珍珠港入口处侦测到一艘日本袖珍潜艇，“伍得”号攻击了这艘袖珍潜艇，将其击沉，同时报告了这次遭遇战。43p56
但是，报告电文没能传递到海军上将金梅尔手中。这艘袖珍潜艇是由日本大型潜艇携带进入这一海域，用以增援他们的航母舰载机攻击的5艘袖珍潜艇之一，这5艘艇没有一艘返回其母艇。43p56
珍珠港遭袭击之后，美国仅剩潜艇能立即用于对日战争。华盛顿一接到被攻击的消息，海军作战部长随即坚决地打破了美国的惯例，下令对这个岛屿帝国实施无限制的潜艇战。这支“海豚式的海军”使用破旧落后的装备，在数月中 进行了鲜为人知的、旷日持久的消耗战。但到最后，它们切断了日军的后勤补给线，迫使日军在饥饿中投降。对于美 国在太平洋上所取得的胜利来说，潜艇建立了较大的功勋。43p56
战争爆发时，美国在太平洋战区的潜艇划分为太平洋舰队潜艇部队(驻守在珍珠港)和亚洲舰队潜艇部队(以马尼拉 湾的甲米地为基地)两部分。它们分别是：小型的"S"级潜艇，其巡航半径较小；还有一些用鱼类和其它海洋生物命名的战 斗力较强的潜艇；以及几艘更新式的“小鲨鱼”级大型潜艇样艇，这种潜艇长312英尺，巡航半径12000海里，它可携带24枚鱼雷，有10个发射管，艇艏6个，艇艉4个，艇上还有一门3英寸炮和一些轻型自动武器。对日战争中使用的主要 就是这种型号的潜艇。当更多的大型潜艇投入使用时，“S”级潜艇就退出了战斗序列。战争爆发时，太平洋舰队拥有21艘大型潜艇，但却有超过一半的艇正在进行修理、现代化改装或者试航。亚洲舰队有23艘大型潜艇和6艘”5"级艇。此 时，在远东还有13艘荷兰潜艇。43p56
日军最初有60艘潜艇：46艘"I"级艇和14艘"RO”级艇。"I"级艇是一种大型潜艇；“RO"级艇是中型潜艇，战争后期发 展起来的"HA"级艇是一种小型潜艇。另外，值得提到的是日本使用了一些袖珍潜艇。起先，日本人的鱼雷比美国的可 靠，速度高，航程远，弹头威力更大。这种适合于水面舰艇运载的”长矛”鱼雷，将其直径由24英寸缩小为21英寸，以 符合日本潜艇发射管的要求。日本人还有低噪音齿轮传动装置，但日军的潜艇直到战争后期一直缺乏雷达。43p56
日军的潜艇没有象大多数的潜艇那样，主要充当劫掠商船的角色。它们的艇长们的武士道精神促使它们主要以军舰为目标。然而，美国潜艇通过不间断地攻击日本货船，削弱日军的战争潜力。日本人忽视了盟军所依赖的且易受攻击的油船和货船，这些油船和货船通常跟随在有良好防护能力的战斗舰艇后面航行。43p56
太平洋舰队第一艘进行战斗巡航的潜艇是“鲍(鱼勾)鱼”号，它于1941年12月11日离开珍珠港，“绿鳕”号和”潜水者” 号几天后随之出发，并于1月初到达日本一带海域。“绿鳕”号击沉两艘敌军货船，“潜水者”号击沉一艘。“鲍(鱼勾)鱼”号 在巡航时没能击沉敌船，但在返航途中运气还不错，因为，和其它轴心国一样，日本人的潜艇有打破无线电静默的冒险惯例。43p56
日本人唠唠叨叨的毛病，使得驻珍珠港的罗奇福特战斗情报分队利用无线电测向仪跟踪敌潜艇成为可能。美军的预警报告有利于盟军货船及时驶离敌潜艇的航线。1月底，美军情报分队正在跟踪日军”1-173”号艇，该艇自我暴露帮 助了跟踪者侦察到它的位置。战斗情报分队记录了“1-173”号艇的航线几乎与正在返航的“鲍(鱼勾)鱼”号潜艇在一条相遇 的航线上，即向这艘美国潜艇传递了情报，“鲍(鱼勾)鱼”号下潜等待。不久，在预计的时间里，“-173”号呈水面航行状 态驶来，舱盖开着，人员在甲板上吸烟和晒阳光浴。“鲍(鱼勾)鱼”号发射了3枚鱼雷击中了它，“I-173”号迅速下沉。这43p56
1941年12月10日，当日本轰炸机攻击马尼拉湾的甲米地海军基地的时候，亚洲舰队的多数潜艇都采用下潜来拯 救自己。但是“海狮”号停泊在码头，被两枚炸弹直接击中而退出战斗。当时在菲律宾的大多数水面舰船已撤退到爪 哇，但是，潜艇和老式的补给舰”卡诺帕斯”号仍留在甲米地，接受海军上校约翰威尔克斯的指挥。43p56
威尔克斯在环绕吕宋岛防御警戒线部署了留下的28艘潜艇，这对抵抗日本人向菲律宾的入侵毫无作用。这些潜艇 对敌战舰、运输船和运送敌人登陆兵的货船进行了31次攻击，发射了66枚鱼雷，但是仅击沉了3艘货船。43p56
1941年圣诞节，当麦克阿瑟决定放弃马尼拉时，被留下来的潜艇失去了基地而且很快就断了燃料。到12月底，它 们全部撤退到爪哇岛的主要港口苏腊巴亚(泗水)。同时撤退的有威尔克斯、亚洲舰队总司令托马斯C哈特上将和他们的43p56
此后，当美军潜艇继续进行巡逻时，它们开始担负向巴丹和科雷希多岛提供补给的任务，为那里的守军运去食品、医药品和弹药，并带出潜艇零部件、鱼雷、贵重物品及重要人员。“鳟鱼”号申请带回25吨物资，其中有2吨金条，18吨袋装银币和5吨美国邮件及其债券票据。在“鳟鱼”号返回基地途中，用鱼雷攻击了敌军一艘货船和一艘猎潜艇。在 撤退的人员当中还有菲律宾总统曼纽尔奎松、副总统瑟吉奥奥斯蒙纳和陆军、海军的飞行员，以及不可轻视的密码破 译人员。这些秘密情报分析人员如果落在后面而被俘，可能会被迫泄露他们的重要机密。最后一艘停靠科雷希多港的 潜艇是”旗鱼”号，该艇在5月3日晚带走了12名军官，12名军队护士、1名军人妻子和装满17大箱的财务报表及其它档 案。大约48小时之后，麦克阿瑟在菲律宾的代表乔纳森温赖特少将被迫缴械投降。43p56
委派给亚洲舰队潜艇的第二个军事任务，是防护从苏门答腊经过爪哇一直延伸到帝汶岛的岛屿连线上的“马来屏 障”。这项任务的执行没能比他们在防护吕宋岛时取得更大的成功。1942年1月至3月底之间，他们击沉了8艘舰船，其中有一艘驱逐舰。但是没能减慢日本人的进攻。在这一时期里美军损失了3艘潜艇。43p56
随着盟军的联合攻击舰队在爪哇海战斗中的失利，苏腊巴亚港已经岌岌可危。威尔克斯上校将他的总部迁移至澳大利亚的弗里曼特尔为基地。5月份，他按期轮换回国，被授予功勋奖章。他的接班人是海军少将查尔斯A洛克伍得。 洛克伍得将亚洲舰队潜艇编入西南太平洋舰队潜艇部队，并以澳大利亚的布里斯班为附属基地。43p56
6月初，正在筹划中途岛战役的尼米兹上将派遣了19艘潜艇控制中途岛的所有航道，以支援保卫中途岛的航母编 队。这些潜艇几乎没能完成上述任务。“舡鱼”号用鱼雷攻击了“加贺”号航母，但鱼雷没有爆炸却穿过该舰击沉了“苍龙” 号[扫校者注：“加贺“号、“苍龙”号已在早先的战斗中被美舰载机重创，丧失战斗力。]。那天夜里，重型巡洋舰”最 上“号和“三限”号在机动规避美国潜艇”红石鱼”号时发生碰撞，“三限”号受损后速度减慢，后来成为美国航母舰载机的牺 牲品。43p56
美国潜艇在太平洋战争初期所取得的战果远比所预期的要少，其主要原因不仅仅是因为鱼雷不够可靠，而且还因为战术理论的缺陷。美军和平时期的战术理论认为，先敌进攻仅限于水面舰艇，而夸大了潜艇易受攻击的弱点，过份强调小心谨慎。因而更加使得战争初期一些潜艇艇长过于小心翼翼。这些人不久被替换下来，代之以一些生性机敏果敢而又乐于冒风险的那些从事潜艇战所必需具备的素质的人。战争初期利用声纳制导攻击的尝试徒劳无功，使用潜望镜在白天通过短促的观察后下潜攻击的效果也一样。更新的攻击战术发展以后，利用可靠的鱼雷射击自动计算机和雷达快速获取情报系统这些美军已经拥有的技术，取得了有效的战果。43p56
1942年8月中旬，两个连的美海军陆战队员袭击了位于吉尔伯特群岛的马金岛，希望由此转移开日军对在瓜达尔 卡纳尔岛上挣扎的同胞们的补给。美国两艘最大和最慢的潜艇”鹦鹉螺”号和“舡鱼”号担负运送和撤出陆战队员的任务。 这一作战行动提高了美国的士气，但是从战略角度看，这次行动是一个失败。日军没有从瓜岛转移开，反而开始在吉 尔伯特群岛，尤其是塔拉瓦岛建起坚固的防御工事，在一年多后，使美军付出了许多生命。43p56
洛克伍得将军对远在布里斯班的附属基地只有行政上的指挥权，而该基地的11艘老式的"S"级潜艇的作战控制权则 由拉尔夫W·克里斯蒂上校行使。在美国进攻瓜达尔卡纳尔岛时，克里斯蒂派遣他的潜艇去封锁日军在俾斯麦群岛和所 罗门群岛北部的基地。他的指挥当即见成效。1942年8月10日上午，几艘两天前在萨沃岛战役中夜间对盟军进攻部队 实施了毁灭性打击的巡洋舰，在胜利狂欢中向卡维恩返航。正在这一防区内巡逻的美军”S-44”号潜艇，发射了4枚鱼 雷，击中了其中的1艘——重型巡洋舰“加古”号，该舰的锅炉爆炸，在5分钟内就沉没了。这艘落后的、已有17年舰龄 的美国“S”级潜艇，捕获到如此庞大的猎物并将其击沉。43p56
美国潜艇尽力保持不进入自己的水面舰艇作战区域，以此最大限度地减少美国潜艇可能被自己的水面部队攻击的危险[这是一个值得重视的问题，因为空军和海军过去都倾向于先实施轰炸射击然后再提出询问识别对方。因为缺少识别或是误解识别信号，导致至少有28艘美国潜艇被美国飞机轰炸或射击过，另5艘曾遭到美国水面舰 艇炮击，“剑鱼”号和“海狼”号被友军击沉，另9艘潜艇遭到损伤。]。这种有一次例外，即1942年10月，在瓜岛战 斗最激烈的日子里，“琥珀鱼”号向图拉吉岛运送了一次航空油，这是战争期间美国潜艇仅有的一次充当油船的事例。43p56
1943年1月，尼米兹的下属、太平洋舰队潜艇指挥官海军少将罗伯特英格利希在一次飞行事故中丧生。洛克伍将得军被调到珍珠港去接替英格利希的指挥。同时，拉尔夫克里斯蒂晋升为海军少将，接管了弗里曼特尔的部队。詹姆 斯法伊夫上校接替了克里斯蒂在布里斯班的职务。43p56
洛克伍得马上着手建立一个比珍珠港离潜艇巡逻区更短的潜艇基地。他选中了中途岛，并在岛上配备了补给船和最低限度的设施。这一变动引起潜艇人员的强烈反对，他们抱怨中途岛上什么也没有，是个”兔子都不拉屎”的地方。 洛克伍得同意潜艇人员有一个疗养地。他安排了一个计划，用船定期往返接送休息和休养人员去珍珠港，并在檀香山 接管了“皇家夏威夷旅馆”,专供这些人员休息住宿使用。43p56
1941年12月9日，一艘在新加坡北部巡逻的日军潜艇报告了英国军舰“威尔士亲王“号和“反击”号的位置，于是，日 军在西贡基地的海军飞机前去摧毁了这两艘军舰。一个月以后，日潜艇"1-6”号发射的鱼雷击中了美国航空母舰“萨拉托 加"号，使它5个月不能参战，正好没赶上中途岛战役。43p56